Artista visual multidisciplinaria. Estudió Medicina Forense y Ciencias de la Comunicación en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). A finales de la década de 1980 y principios de los noventa formó parte del colectivo Grupo SEMEFO, una plataforma fundamental para la experimentación artística en México que cuestionó los límites tradicionales del arte a partir de una reflexión directa sobre la muerte y sus representaciones.
A lo largo de su trayectoria, Margolles ha desarrollado una práctica centrada en el análisis de la violencia estructural en México, abordando las consecuencias sociales del narcotráfico, la desigualdad y la impunidad institucional. Su obra se enfoca en los llamados “daños colaterales” de estos procesos, utilizando materiales, rastros y acciones mínimas para visibilizar la ausencia, el duelo y la memoria de las víctimas desde un lenguaje sobrio y contenido.
Ha participado en numerosas bienales internacionales, incluida la Bienal de Venecia en tres ocasiones, donde representó a México en la 53ª edición (2009) con el proyecto ¿De qué otra cosa podríamos hablar?, curado por Cuauhtémoc Medina, y recibió una mención especial en 2019. Entre sus reconocimientos destacan el Premio Príncipe Claus y el Artes Mundi, ambos otorgados en 2012. Su obra ha sido presentada en instituciones como el Migros Museum für Gegenwartskunst, el CA2M, el MUAC, la Tate Modern, el Centre Pompidou y el Museo Tamayo, y forma parte de importantes colecciones públicas y privadas a nivel internacional.